山东曲阜的孔庙是真正的孔氏家族的祖庙，这是确凿无疑的，但还有一座孔氏后裔居住过的孔庙，那便是鲜为人知的衢州孔庙。
浙江衢州的这座孔庙，建于800多年前的南宋时代。当时金兵大举侵犯中原，孔子第48代孙、衍圣公孔端友，负着孔子和亓官夫人(孔子夫人)的一对楷木像自山东老家南逃至衢州。南宋王朝且把“杭州当汴州”，偏安于杭州，孔端友奉祀北归的愿望化做泡影，于是就求助于朝廷及地方官府资助，沿袭曲阜孔庙形制在衢帅|建造了这座孔氏家庙，是为南宗。这样就有了由孔裔奉祀的山东曲阜和浙江衢州的两处孔庙。
衢州孔庙曾经三迁三建，十多次修葺。现址的孔庙为明朝明武宗正德十五年(1520年)所建，位于衢州城区东隅，基本上按照山东曲阜的规模建造，分孔庙、孔府两个部分。衢州孔庙不及曲阜阔大，却颇精整，另含一番深峻气象。整个建筑坐北朝南，庙前设有“金声”、“玉振”、“棂星”、“大成”四门。金声、玉振两门之外，有“德侔天地”、“道冠古今”两块牌坊。进内是祭祀孔子时歌舞的地佾台。紧接佾台的是孔庙的主殿大成殿，其建筑雄伟壮观，重檐歇山式结构，双重飞檐中立有一块竖匾，上书“大成殿”三字，为清朝雍正皇帝御书的仿制品。殿内正中是孔子座像，两旁侍立着其子伯鱼及孙子思像。横梁上悬有十余块历代皇帝御书匾额。殿前通道的东西两侧各有九间房子，叫作“两庑”，是供奉先贤的地方。东庑有中兴祖玉像，西庑有孔端友像。金声门左，是家塾所在内进为崇圣祠，祠后是圣泽楼，旧称御节楼；祠前稍西为报功
祠，祭祀官绅之有功于南宗者。玉振门右有五支祠、袭封祠、六代公爵祠及思鲁阁等建筑。
思鲁阁正殿前神龛内安放的孔子及亓官夫人楷木像，是孔府最珍贵的祖传瑰宝，历代正朝都视之为国宝。相传孔子死后，其弟子子贡守墓三年，日日思念，默想老夫子的形象，用楷木精心雕刻而成。据学者考证，这座塑像虽无法证实确系子贡所制，但从雕刻的线条与刀法，以及所刻形像与服饰观之，至少雕成于汉代以前，是极珍贵的文物。这对楷木像高不满2尺，孔子长袍大袖，手捧朝笏；亓官夫人长裙垂地，形象生动。据民间传说，当年衍圣公孔端友背负两尊祖宗圣像，率家人南逃，突遇金兵来袭。眼见楷木圣像将被金兵掳劫，此时突然刮起一阵狂风，把船只掀翻。金兵见此情景，便收兵而去。正当孔端友急命家人打捞楷木像时，只见河面上，有三位神人踏着祥云，将楷木像奉还，原来是孔子故乡的山神特来救护圣像。从此楷木雕像在南宗孔庙历经整整27代，保存了860多年。抗战时，衢州被日军占领，孔庙内大批祭器及南宋以来所藏文物被劫掠一空。孔子夫妇的楷木塑像，因事先已被转移到深山里，才得以保存。至今，在孔氏家族后代子孙的心目中，孔子楷木像就像是孔圣人的化身，是至高无上的神，有着极高的神威和法力。
大成殿西侧的思鲁阁是曲阜孔庙所没有的建筑。这是南宗孔氏子孙为表达他们思念山东曲阜和家人而精心设计建造的。“思鲁阁”是一座古色古香的二层楼房，现辟为孔氏家庙陈列室。阁内除存放着稀世珍宝孔子及亓官夫人楷木像(复制品)外，阁下竖有目前南宗孔庙最有价值的“镇庙之宝”——先圣遗像碑。这座碑是动乱中的幸存品。碑的正面刻有“先圣遗像”，相传为孔端友根据唐代画家吴道子稿本摹刻。碑的背面是“诏建衢州孔氏家庙”示意图。先圣遗像碑记上刻有“德配天地，道冠古今，删述六经，垂宪万世”l6个大字。孔子遗像有真人那么高， “衣冠佩剑，色温而厉，威而不猛，恭而安之”。为了帮助人们能够直观地了解孑L子，思鲁阁内还新塑了一尊孔子像，供人们瞻仰。
祭孔佾舞是祭孔活动中的一个必不可少的仪式。众所周知，祭孔大典历来是作为国家庆典活动而受到广泛重视，所以祭孔仪式也越来越隆重，越来越复杂。佾舞就是在这种场合下表演的一种场面极为宏大的大型舞蹈，演出时演员近百人。佾舞作为庙堂艺术的一宗遗产，对后人了解古代文化艺术具有重要价值。