夫子庙位于秦淮河北岸，原是祀奉孔子的地方。古时立学必祀奉孔子，南京夫子庙是前庙后学的布局。孔庙、学宫与东侧的贡院(通过考试来取±的考场)组成三大文教古建筑群。庙前设照壁、棂星门，东西设牌坊，形成一个庙前广场。棂星门前有一个半圆形水池，称为“泮池”。夫子庙的大照壁位于秦淮河南岸，全长ll0米，气势磅礴，为全国照壁之最。泮池是孔庙的特有形制，源自于周礼，而夫子庙凿秦淮河为泮池，是惟一利用天然河道作为泮池的特例。岸北为石栏，有“天下文枢”牌坊。意思是说天下文章都汇集于此。
棂星门后就是孔庙的正门大成门，门内正中有汉白玉屏风，上面镌刻《重修夫子庙记》，旁边树立四块古碑，其中齐永明二年(484)的“孔子问礼图碑”是从南京市人民政府院内迁至此处的一块重要碑铭。入大成门循甬道丹墀而上，便是夫子庙的主殿大成殿。殿内正中有一座4米多高的孔子雕像，十二位得意门生的汉白玉雕像也分立两侧。殿前有宽敞的露台，四周绕以石栏板，它是古时祭祀举行乐舞的地方。殿前两侧有廊庑相连，原来是供奉孔门七十二贤人和历代大儒以及存放祭器的地方。现在已经改作碑廊，墙上镶嵌陈列当今名流的书法碑石30多块。
大成殿后的尊经阁，当年是存放典籍的地方。著名的孙吴四大传世名碑之一《天发神谶碑》(又称三段碑)就是清朝嘉庆年间在这里被一场大火烧毁的，这是中国书法史上的一件憾事。如今，只能在总统府西花园的墙壁上欣赏品评它的复制品了。